Il battistero fu realizzato al tempo del vescovo Pannilini (1775-1823) con materiale lapideo in parte proveniente dalla antica basilica extra-urbana di Santa Mustiola, come sembrano attestare le due colonne tortili in marmo verde scuro dell’edicola, forse pertinenti ad un antico ciborio. Il fonte battesimale è composto da un ampio vaso monolitico di alabastro dalle pareti baccellate, forse già collocato in cattedrale, sovrastato da una moderna statua del Battista. La decorazione pittorica si deve all’intervento di Arturo Viligiardi (1869-1936).